돌아오지 않는 숲

우리나라에 이런 설명이 없는게 너무 아쉬워서 제가 하나 써내려 갑니다.
하.. 하루종일 이 간단한걸 해보기 위해 구글을 뒤지고 다녔던 걸 생각하면 눈물이 앞을 가리네요.

 우선 출처부터 써내려 갑니다. 
 
http://www.daniweb.com/software-development/python/threads/119693 

 제가 하려고 하는것은 어떤 컬럼으로 구분된 데이터 파일에 있는 숫자를 읽어서 

각각의 변수들을 제가 원하는 어떤 함수에 집어 넣는것입니다.

참 간단한데. 아무리 찻아도 찻아도 찻을수가 없는.. 팁입니다.

우선 numpy 라고 불리는 numerical한 계산을 많이 해주는 패키지를 import 합니다.
(앞으로 물리학을 하면서 python을 계속 쓰려면 이 패키지를 심층 분석해봐야 겠습니다. ) 

>>from numpy import *
>>f = loadtxt("test.txt")
>>firstculum = f[:, 0]
>>print firstculum
[1,2,3,....., 999, 1000] 

딱 봐도 느낌이 팍오는 소스입니다.  
 
첫번째 컬럼을 읽는 소스이죠? 
이제 잘 활용해서 쓰기만 하면 되겠죠?  

리눅스를 사용하는 많은 분들이 즐겨 쓰는 컴파일러는 단연 gcc 이죠. 리눅스의 웬만한 프로그램들의 기본을 이루고 있을 뿐만 아니라 무엇보다도 무료라는 점이 매력적입니다. (vidual stdio의 가격을 생각해 본다면 참;; )

그런데 의외로 사람들이 잘 모르는 부분중에 하나가 gcc가 시중에 있는 웬만한 컴파일러에 비해 컴파일한 프로그램의 속도가 느리다는 것입니다. 계산 과학쪽을 하는 사람들뿐만 아니라 어떤 상용프로그램들도 느리다는 건데요. (그렇다고 인텔 cpu에서만 작동하는 프로그램도 웃기겠네요.)
그런 문제를 해결해 주는 상당히 고속의 컴파일러가 있습니다. 
바로 intel compiler에요. ^^ 리눅스에서 명령어로 쓸려면 icc 라고 쓰고 gcc랑 동일하게 사용하시면 됨니다. 

우선 설치를 해보도록 하죠. 먼저 인텔 홈페이지에 들어가서 무료인 noncommercial version을 받습니다. noncommercial version은 아쉽게도 맥이나 윈도우에서는 사용할수가 없습니다. 
가서 약관에 동의하고 자신의 머신의 기종에 따라(32bit인지 64bit인지) 컴파일러를 다운받습니다.  기종을 확인하는 법은
$cat /proc/cpuinfo
를 봐서 CPU기종을 확인 하는 방법이 있고
$uname -a
란 명령어로 운영체제의 종류를 파악합니다. i686 이면 32bit, x86_64이면 64bit 입니다. 중간에 메일주소를 써줘야하는데 잘 써줘야 합니다. 그래야 씨리얼번호가 제대로 오거든요. 
다운을 다 받았으면 먼저 JAVA Runtime Environment 란걸 먼저 설치해줍니다. 이게 없으면 인스톨이 안되요. 원래 어느정도 충족조건이 있지만 웬만한건 다 충족하고 이게 충족이 잘 안됩니다. 

$sudo apt-get install gcj

JAVA Runtime Environment 가 이렇게 설치가 되면

$tar xvfz l_ccompxe_(.....).tgz
$cd ./l_ccompxe_(.......)
$sudo ./install.sh
을 해주면 인스톨을 하기 시작합니다. 

Ubigraph 란 것을 알게된지도 좀 됬었는데 그동안 포스팅을 한다고한다고 하는걸 이제야 포스팅 하게 되네요. 물런 잘쓰시는 분은 그냥 보기만 하면  바로바로 따라 하실수 있습니다. 
Ubigraph란 어떤 종류의 네트워크나 시스템의 움직임이나 모습을 시뮬레이션을 하면서 실시간으로 그것들의 동력학적 변화를 눈으로 볼수 있게 해주는 아주 유용한 툴입니다.  일단 동영상을 보시죠.  


그냥 봐도 화려하죠?  
우선 설치하는 법부터 알려드리죠. 

http://ubietylab.net/ubigraph/index.html

홈페이지에 들어가셔서 자신의 컴퓨터와 운영체제에 맞는 것을 다운로드 합니다. 

$ tar xvfz UbiGraph-....tar

$ cd UbiGraph-...

$ bin/ubigraph_server &                    (empty black window)

$ cd examples/Python

$ ./run_all.sh

이렇게 하면 설치가 완료된것입니다. 마지막에 보면 실행이 잘 될거에요. 중간에 검은 윈도우가 떠야합니다. 그게 안뜨면 안돼요. 그게 안될경우에는 xmlrpc쪽이 문제일수도 있지만 웬만하면 잘 뜹니다. 잘 안뜨면 컴퓨터가 정말 이상한것일 가능성이 있습니다. 이 글을 쓰면서 그 문제를 어떻게 해결해야 하는 기억이 나지 않아서 한 4시간을 버렸네요... 정말 이럴때마다 이런야가 너무 싫어지네요. 너무 화가 나요. 전에 몇번 깔아 봤었기 때문에 쉬울줄 알았는데 엉뚱하고 쓸데없는데서 시간을 허비했네요 ㅠ_ㅠ 다시한번 기록의 중요성을 느낌니다. 이제 뭘 하든간에 무조건 다 기록하는 습관을 남겨야겠습니다. 

홈페이지에 나온 템플릿대로 쓰면 웬만하면 다 됩니다. 
소스 코드에 대한 설명을 하자면 이것은 랜덤 그래프인데요. 

소스코드 쓰실땐 한글부분은 모두 지우고 쓰세요. 

#!/usr/bin/python

import random as rd
#랜덤함수를 사용하기 위해서 라이브러리를 불러줍니다.

import xmlrpclib 

import time
#중간에 쉬는 시간을 주기위해 넣어줍니다. 너무 빨리 없어지면 보지를 못하죠. 

server_url = 'http://127.0.0.1:20738/RPC2'

server = xmlrpclib.Server(server_url)

G=server.ubigraph
#이 부분은 템플릿이라고 생각하시면 됩니다. 자세한건 저도 xml쪽을 잘 몰라서 모르겠네요. 

G.set_edge_style_attribute(0, "color", "#fff000")

G.set_edge_style_attribute(0, "width", "3.0")
#edge 즉 링크의 색과 굵기를 지정해줍니다. 

G.set_vertex_style_attribute(0, "color", "#ff0000")

G.set_vertex_style_attribute(0, "shape", "sphere")

#vertex 즉 노드의 색과 모양을 지정해 줍니다. 크기도 조절할수 있고 라벨도 붙일수 있습니다.

for i in range(100) :

G.new_vertex_w_id(i)
#일단은 공간에 노드들을 만들어서 뿌립니다.  

time.sleep(0.5)
#잠깐 쉬어주구요. 

for i in range(100) :

for j in range(i+1, 100) :

if rd.random() < 0.15 :

G.new_edge(i,j)

time.sleep(0.1)

#어떤 확률에 따라서 가능한 링크들을 연결해줍니다. 

ubigraph의 장점은 무엇보다도 웬만한 모든 언어를 지원 한다는 것입니다. 어떤 놈들을 python만 지원 되거나 어떤 놈들은 c만 지원 되거나 하는 단점이 있는데 이 프로그램은 들어본 거의 모든 언어에 사용할수 있다는 장점이 있습니다. 

홈페이지에 들어가면 아주 다양하게 응용해서 쓰는데요. 물리학분야에서 많이 쓸수 있을거라고 기대해 봅니다. 이것을 이용해서 복잡한 분자의 구조라던지 결정모양의 고체의 구조를 나타낼수 있을 뿐만 아니라, 그것들을 움직이게 하므로써 물질의 동력학적인 행동들을 눈으로 확인할수 있다는 장점이 있습니다. 

gnuplot을 쓰다 보면 대부분 사람들이 그렇지만 (저도 그렇고) 그냥 패키지를 apt-get 으로 깔아서 사용합니다. 
sudo apt-get install gnuplot 
하지만 이렇게 하는 경우 종종 불편을 호소하는 경우가 많은데요.  
del키가 안먹는 다든가.. 맘에 안드는 wxt를 써야 한다던가의 일이죠. (전 그냥 깔아서 쓰는걸 좋아합니다..ㅠ_ㅠ 삽질 미워요..)
X11 포워딩으로 쓰는게 좋기도 하구요.(결국 실패.. ) 확실히 한번 고생하면 그후론 참 편하죠.

• libwxgtk2.8-dev – for the wxt terminal
• libpango1.0-dev – for the cairo (pdf, png) and wxt terminals
• libreadline5-dev – readline support (editing command lines)
• libx11-dev and libxt-dev – X11 terminal
• texinfo (optional) – needed for the tutorial
• libgd2-xpm-dev (optional) – old png, jpeg and gif terminals based on libgd

sudo apt-get install libwxgtk2.8-dev libpango1.0-dev libreadline5-dev libx11-dev libxt-dev texinfo libgd2-xpm-dev

컴파일 인스톨을 위해선 우선 위의 패키지가 꼭 필요 합니다. 

그다음에 웹에서 gnuplot 의 소스 파일을 다운 받습니다.

압축을 풀고 (tar xvf gnuplot-4.4.3.tar)
디렉토리로 들어갑니다. (cd gnuplot-4.4.3)
자.. 이 작업이 끝났으면
./configure
make
make check 
(gnuplot 이 잘 작동하는지 테스트합니다. skip하셔도 됨. 현란한 움직임들을 보고 있자니 제가 gnuplot의 능력을 1%도 못쓰고 있다는 기분에 빠져듭니다.. =_=;;;)
sudo make install

끝... 참 쉽죠? 이럼 wxt기준으로 깔리면서 텝이나 다른 커멘드라인 명령어를 잘 수행하는 gnuplot을 설치하게 됩니다.

원래는 ./configure 뒤에 많은 옵션들을 해줘야 하지만..
( ./configure --prefix=$HOME/usr --enable-history-file --with-readline=gnu --x-include=/usr/include/X11 --x-libraries=/usr/X11/lib 이런 옵션들요.. )

요즘은 이렇게만 해도 잘 깔리네요.. 

ps. X11을 터미널로 설정하는 법 알아냈습니다. 위의 방법을 쓴다음에 .gnuplot 이란 파일을 홈디렉토리에 만들어서 set term x11을 한줄 넣으시면 됨니다. 그냥 echo "set term x11" > .gnuplot 하시면 되겠네요. ㅋ  

금요일인데 이번에 연구실에 고가로 주분한 컴퓨터에 우분투 리눅스(ubuntu server version 10.10 amd64)를 깔고 있습니다. 

나도 한때는 오페라를 메인 브라우저로 쓰곤 했었다. 지금은 왜 안쓰냐고? 그건 오페라가 기대에 못 미치거나, 한국의 실정에는 맞지 않는다는 자괴적인 심정에서가 아니라, 단지 블로그에 글쓸때 불편하다는 점 때문이다. 만일 얌전하게 웹서핑이나 하면서 남이 쓴 글을 보고만 있는다면, 오페라를 계속 쓰고 있었을 것이다. 그리고 파폭같이 이것저것 만지는 잔 재미때문에 오페라를 손대는 일이 자연히 줄어들고 말았다.

그런데 요즘 여기저기에서 오페라에 대한 글을 자주 볼 수 있다. 그동안 말로만 들었는데, 실제로 써보고 나니 대단한 브라우저라면서 칭찬을 하는 글들이 많다. 동감이다. 오페라 브라우저는 브라우저 자체만의 완성도로 볼 때에는 최강의 브라우저임이 틀림없다. 요즘 모바일, Wii 같은 게임기로 영역을 확장하면서, 지명도도 많이 올라간 상태이다. 이번 글에서는 그런 오페라 열풍, 아니 미풍에 조금 더 힘을 실어줄까 해서, 오페라의 장점 몇가지를 얘기해보고자 한다.


1. 가볍고 빠르다.

오페라의 스피드는 국내외를 막론하고 다들 최고라고 인정하는 부분이다. 단순히 아이콘을 클릭해서 뜨는 기동 시간을 말하는 것이 아니라, 실제로 써보면 체감 속도에서 경쾌함을 느낄 수 있다.


2. 브라우저 + (알파)

오페라는 단순히 웹브라우저 기능만 있는 것이 아니다. 이메일, RSS, 채팅, 뉴스 그룹 등, 웬만한 인터넷 도구는 거의다 내장하고 있다. 그러면서도 용량은 파이어폭스보다 작다. 혹자는 그런 통합 프로그램은 복잡한데다, 기능도 전용툴에 못 미친다고 싫어한다. 하지만 오페라의 기능은 더도말고 덜도말고 딱 적당하다. 특히 이메일 같은 경우엔 POP3 를 지원하기 때문에, 네이버나 지메일도 한꺼번에 읽어들일 수 있다. 당연히 웹메일로 접속해 보면, 읽지않은 메일의 수도 0 으로 초기화된다. 나는 이메일 기능 때문이라도 오페라를 가끔씩 돌려보곤 한다. 그리고 뉴스 그룹도 간간히 쓰곤 한다. 뉴스 그룹이나 채팅(IRC) 같은 기능은 별것 아니지만, 막상 쓰려고 하면 막막할 때가 많다. RSS 구독 기능은 그다지 추천하고 싶지 않다. 이건 오페라의 기능이 떨어져서라기 보다는 오프라인보다 온라인 방식이 훨씬 편리하기 때문이다. 개인적으로 한RSS 를 추천한다.


3. 편리한 마우스 기능

마우스 제스쳐야 이제 왠만한 브라우저는 모두 지원하기 때문에 큰 특징은 되지 않는다. 솔직히 오페라의 마우스 제스쳐 설정은 다른 것에 비해 조금 어렵기도 하다. 하지만 조금만 공을 들이면, 막강한 활용이 가능하다. 그동안 오페라에서는 링크 던지기가 안되는 줄 알았는데, 자세히 살펴보니 기본으로 지원하고 있었다. 단지 마우스 오른쪽 버튼을 누른채로 해야된다는 점이 여타의 브라우저와 조금 다르다.

그리고 오페라의 문맥 메뉴, 즉 마우스 오른쪽 버튼을 누르면 나타나는 메뉴는 오랜 브라우저 기술을 축적한 회사답게 친인간적이고 합리적이다. 특히 선택 부분을 메모장으로 바로 저장하는 기능(Copy to note)이나, 음성 전환(Speak) 기능, 검색(Search with) 같은 것은 실제로 써봐야 편리함을 알 수 있다. 지금이야 파폭도 확장기능을 통해 이런 것 대부분을 따라할 수 있지만, 오페라의 안정적인 내장 기능에 비하면 조금 떨어지는 느낌이다. 다시 한번 강조하지만, 오페라의 매력은 사용자를 생각하는 심플한 기능에 있다. 아마 구글을 애용하는 사람이라면, 오페라 또한 좋아할 것이다.


4. 음성 전환 기능 (TTS)

Text to Speech 라고 텍스트를 선택하면, 음성으로 읽어주는 기능을 말한다. 윈도우에도 기본으로 내장돼 있지만, 오페라의 그것과는 품질에서 많은 차이가 난다. 비록 영문만 지원되긴 하지만 네이티브와 상당히 흡사한 발음을 들려준다. (잘 쓰이지는 않지만, 음성으로 브라우저를 컨트롤할 수도 있다.)

Ready for a revolution in the way you access the Web sites you can't live without? Try Speed Dial in Opera's newest Web browser. It makes the fastest even faster.



5. 높은 품질의 이미지 표시
축소된 이미지를 IE 나 파이어폭스로 보면, 많이 찌그러져서 보기가 않좋다. 하지만 오페라는 그래픽 뷰어에 버금가는 높은 품질을 유지해준다. 아래에 예제를 걸어놨으니 직접 비교해 보길 바란다. 보다시피 오페라는 축소된 이미지의 작은 글자까지 읽을 수 있다.

지금까지 생각나는대로 오페라만의 장점 몇가지를 살펴보았다. 마지막으로 조금 과거의 얘기를 하자면, 오페라 브라우저는 버전 8까지 상용으로 팔던 것이었다. 즉 1%도 안되는 점유율을 가지고 있으면서도, 감히 돈받고 팔던 브라우저였던 것이다. 그만큼 자신들이 만든 브라우저에 자신감이 있었다는 얘기다. 지금은 구글과의 제휴와 모바일 지원 등 수익 영역을 확대한 덕분에 무료로 제공되고 있지만 말이다. 아무튼 당신이 파워 웹서퍼가 돼고자 한다면, 오페라는 한번쯤 써봐야 할 필수 브라우저이다.

http://zzzik.tistory.com/221

에서 퍼옴..

오페라라는 부라우저

상당히 괜찮네요.. 한번씩 써보시길..

리눅스에서는 파이어폭스가 있지만 너무느린 경향이 있어요..

근데 이건 가볍고 좋네요..^^

사파리랑 비교해서는 비슷한거 같아요..^^ㅎㅎ

하지만 역시 블로그에 글을 쓸때는 약간 불편하네요..;;; 지금도 불편해요 ..ㅠ_ㅠ

칸이 안맞아서 그런가..;;

종종 통계물리 연구를 하다보면 종종 여러 파일에 대해서 명령어를 연속적으로 입력해 야 할때가 있습니다. 예를 들어서